В состав Центрального духовного управления мусульман России в Томской области входит одна организация – МРО города Стрежевой, который находится на севере региона на границе с Ханты-Мнсийским округом Тюменской области.

Мусульманская община в нефтедобывающем городе возникла в 1994 году. Первым председателем общины стала Рузалия Балагетдинова, имамом по указу муфтия ЦДУМ был назначен Рагунат Гиндуллин, получивший религиозное образование в медресе имени Ризы Фахретдина в Уфе.

В 1996 году организация получила от местных властей помещение в цокольном этаже дома для организации молитвенной комнаты. В 1999 году общине предоставлено более просторное помещение – бывший магазин.

В 2001 году имам-хатыб Рагунат Гиндуллин указом муфтия ЦДУМ назначается председателем мухтасибатского правления северной части Томской области. В 2005 году в Стрежевом создается благотворительный фонд строительство мечети «Аль-Хаят» (Жизнь) под руководством Лачина Байрактарова. В 2006 году указом муфтия ЦДУМ новым имам-хатыбом и председателем мусульманской организации Стрежевого назначен Амирхан Джаннатов.

В 2008 году в Стрежевом началось строительство каменной мечети в два этажа с минаретом высотой 14 метров. Мусульманская организация имеет свою страницу в сети интернет: http://mechetstrejevoy.jimdo.com. Община активно сотрудничает с коллегами из ЦДУМ в соседнем Ханты-Мансийском округе. МРО г. Стрежевой является «спорной» организацией, на которую претендуют как ЦДУМ, так и ДУМ Сибири.