Духовное управление мусульман Тюменской области было зарегистрировано региональным управлением юстиции 10.12.1992 года. Председатель ДУМ Тюменской области - Садыков Зиннат Аюпович.

Централизованная мусульманская организация образовалась в результате выхода Тюменского и Курганского мухтасибата во главе с имамом Галимзяном Бикмулиным из состава Духовного управления мусульман Европейской части России и Сибири (ДУМЕС) и проведения осенью 1992 года учредительного съезда самостоятельного Духовного управления мусульман Тюменской области. Со времени создания и до мая 2014 года централизованной религиозной организацией руководил председатель (муфтий) Галимзян Мисбахович Бикмуллин.

В первые годы деятельности ДУМТО размещалось в молитвенном доме по улице Доронина, 11 в Тюмени. С середины 90-х годов со строительством соборной мечети по улице Жданова, 9, резиденция Духовного управления переместилась по новому адресу.

9 августа 1997 г. на учредительном съезде в Тобольске ДУМТО выступило одним из учредителей Духовного управления мусульман Сибири и Дальнего Востока (ДУМСДВ), впоследствии преобразованном в Духовное управление мусульман Азиатской части России (ДУМАЧР). Галимзян Бикмуллин стал баш-казыем (главным казыем) новой централизованной структуры.

В 1999 году Духовное управление мусульман Тюменской области с большей частью мусульманских организаций вышло из состава ДУМАЧР. Меньшая часть общин, не пожелавшая разрывать с ДУМАЧР, в свою очередь покинула ДУМТО, и провела в октябре 2001 года учредительный съезд Казыятского управления мусульман Тюменской области (КУМТО).

Духовное управление мусульман Тюменской области входит в состав Совета муфтиев России (СМР) в качестве самостоятельного муфтията. Офис ДУМТО сегодня размещается на первом этаже здания по улице Сакко, 55 в центральной части Тюмени. Духовное управление объединяет около 40 мусульманских организаций Тюменской области. В его структуру входит религиозное образовательное учреждение «Ембаевское медресе имени Нигматуллы-хаджи», зарегистрированное 16.03.1993 года. С 2010 года, после окончания срока лицензии, образовательная деятельность в медресе не ведется.

17 февраля 2011 года на отчетно-выборном съезде Галимзян Бикмуллин переизбран пожизненным муфтием духовного управления. В мае в 2014 года он инициировал созыв внеочередного Съезда ДУМ ТО и объявил о своей отставке в связи с состоянием здоровья. Новым председателем организации избран Зиннат Аюпович Садыков.